Яков Бакланов родился 15 марта 1809 года в станице Гугнинской войска Донского. Его отец Пётр Дмитриевич Бакланов был из казачьих детей, мать — казачка Устинья Малахова. На службу вступил 20 мая 1824 года урядником в 1-й Донской казачий полк, в котором командовал сотней его отец. Также известно, что в 1826 году Бакланов обвенчался с дочерью Гугнинского священника Серафимой Анисимовой.

Яков Бакланов участвовал в Русско-турецкой войне 1828–1829 годов. В 1829 году получил звание хорунжие. За отличие в деле с армией великого везиря при Кюлевчи награждён орденом Святой Анны 4-й степени с надписью «За храбрость». 11 июля 1829 года пожалован орденом Святой Анны 3-й степени с бантом за отличие в делах при покорении турецких городов Месемврии и Анхиало.

Также Бакланов является активным участником Кавказских походов. Он стал известен после экспедиции в 1836 году, предпринятой для истребления закубанских аулов между реками Псефиром, Лабой и Белой. В этом месте его ранили в голову. Позже Бакланова наградили орденом Святого Владимира 4-й степени с бантом.

Только в 1867 году Яков Бакланов вышел в отставку и поселился в Санкт-Петербурге. Он умер после долгой болезни в бедности 18 октября 1873 года. Его похоронили на кладбище петербургского Новодевичьего монастыря.